林建章（1874~1940），中华民国时期海军将领（FOTOE 供图）

另一方面，闻知尼港事态紧急的日本政府忧心如焚，海陆援军分头出发，甚至动用破冰船，因冰层太厚而作罢。北部沿海州派遣队由津野一辅少将指挥，而多门次郎大佐所率之庙街派遣队（多门支队）则由库页岛一路北上，再越过河口湾登陆杀来。红军游击队再次撤出，离开之前将俘虏的日本人和白俄人一律处死。这是一个惨案，也是一场屠杀，被处死的日侨中还有一百多名妇女儿童。海参崴的《浦潮日报》披露了屠杀详情，说红军为节省子弹，将俘虏押至江边，刺伤后再沉入冰窟。也有文章称当地很多华人与韩国人参加了红军，中国舰队也向红军提供炮弹，导致日军之败。日本国内一片复仇之声，给中国撤出军舰、接运华侨的计划蒙上浓重阴影。

北洋海军“海容号”巡洋舰此时正在海参崴，舰长林建章被任命为海军代将，在此地设立中国驻沿海州海军代将处，参与协约国的军事协调事宜。林建章深知事体重大，随即声明《浦潮日报》所载内容严重失实，并通过日海军官员交涉，要求该报予以更正。他还电请外交部关注此事，说日本国内传播更广，应令驻日使馆妥善应对。而日方联络员伊田告诉他，似有中国军舰供给红军武器的实证，日本国内为之民情愤激。林建章意识到吉黑舰队在庙街的危险，催促尽快撤出。驻日海军武官林国赓也积极展开沟通，但说日本国内对此事刊载很多，甚至点出相关军官的姓名，建议尽快查清事实，以便交涉和反驳。

6月3日，日军多门支队进入庙街，此地已不见活的日本人，但在搜索战场时发现一名日本军人遗留的日记，随即向报刊披露。6月8日，大阪的《每日新闻》进一步渲染庙街事件，并将矛头指向吉黑江防舰只，说中国军舰曾炮击日本守备队，日军由水上还击，受到12挺机关枪猛烈扫射，遂不支败退。《浦潮日报》也开始连载这本海军通信兵萩原福寿遗留的日记（从3月中旬至5月24日），内容包括日俄交战过程，也写到“（日军）所以蒙巨大之损害者，实因某国炮舰对我守备队施以炮击所致。我守备队一部分虽对之突击，然因受多数机关枪之猛烈抵御，终未成功”。在庙街的华侨与吉黑舰队皆被日军扣留，通信也被切断，说是要等待调查结果。陈世英坚决否认日方的指控，命所部“生火亮械”，每日在甲板擦洗炮弹，严阵以待。日军不敢贸然动手，采用软禁方式，封锁上下江道达半年之久。